diff-cache.c: use the "U <pathname>" format for unmerged entries.

This makes it match "show-diff" behaviour.

[PATCH] diff-cache/tree compatible output for show-diff (take 2).

This makes diff-tree-helper handle ("warn about") unmerged path entries

    U <path> <record-terminator>

This is emitted once per unmerged path, no matter how many unmerged
stages there are.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

show-diff: don't print out the full "ce" format for unmerged files

It really doesn't make sense, since there are potentially _many_ different
cache entries for an unmerged file. So just do the "U pathname" thing.

show-diff: match diff-tree and diff-cache output

You'll need "diff-tree-helper" to show the full diff, but Junio is
dead set on adding a "-p" argument to all three to avoid it. That's
next..

git-pull-script: do automatic merges

When the trivial "read-tree" merge fails, fall back on the (equally
trivial) automatic merge script instead of forcing the user to do
it by hand.

When _that_ fails, you get to do a manual merge.

[PATCH] introduce xmalloc and xrealloc

Introduce xmalloc and xrealloc to die gracefully with a descriptive
message when out of memory, rather than taking a SIGSEGV.

Signed-off-by: Christopher Li<chrislgit@chrisli.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

update-cache: remove index lock file on SIGINT

This makes it a lot more pleasant to use when you
interrupt a long-running operation.

[PATCH] diff-cache buglet

diff-cache attempts to first remove all merge entries before letting the
diff_cache() do its work, but it incorrectly stops after the first
merge-entry it finds.

Fix by just replacing the "break" with a "continue".

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Diff-tree-helper take two.

This reworks the diff-tree-helper and show-diff to further make external
diff command interface simpler.

These commands now honor GIT_EXTERNAL_DIFF environment variable which
can point at an arbitrary program that takes 7 parameters:

  name file1 file1-sha1 file1-mode file2 file2-sha1 file2-mode

The parameters for an external diff command are as follows:

  name        this invocation of the command is to emit diff
      for the named cache/tree entry.

  file1       pathname that holds the contents of the first
      file.  This can be a file inside the working
      tree, or a temporary file created from the blob
      object, or /dev/null.  The command should not
      attempt to unlink it -- the temporary is
      unlinked by the caller.

  file1-sha1  sha1 hash if file1 is a blob object, or "."
      otherwise.

  file1-mode  mode bits for file1, or "." for a deleted file.

If GIT_EXTERNAL_DIFF environment variable is not set, the
default is to invoke diff with the set of parameters old
show-diff used to use.  This built-in implementation honors the
GIT_DIFF_CMD and GIT_DIFF_OPTS environment variables as before.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Introduce diff-tree-helper.

This patch introduces a new program, diff-tree-helper.  It reads
output from diff-cache and diff-tree, and produces a patch file.
The diff format customization can be done the same way the
show-diff uses; the same external diff interface introduced by
the previous patch to drive diff from show-diff is used so this
is not surprising.

It is used like the following examples:

   $ diff-cache --cached -z <tree> | diff-tree-helper -z -R paths...
   $ diff-tree -r -z <tree1> <tree2> | diff-tree-helper -z paths...

 - As usual, the use of the -z flag is recommended in the script
   to pass NUL-terminated filenames through the pipe between
   commands.

 - The -R flag is used to generate reverse diff.  It does not
   matter for diff-tree case, but it is sometimes useful to get
   a patch in the desired direction out of diff-cache.

 - The paths parameters are used to restrict the paths that
   appears in the output.  Again this is useful to use with
   diff-cache, which, unlike diff-tree, does not take such paths
   restriction parameters.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Split external diff command interface to a separate file.

With this patch, the non-core'ish part of show-diff command that
invokes an external "diff" comand to obtain patches is split
into a separate file.  The next patch will introduce a new
command, diff-tree-helper, which uses this common diff interface
to format diff-tree and diff-cache output into a patch form.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

fsck-cache: show root objects only with "--root"

This makes the default fsck behaviour be quiet for a repository
that doesn't have any problems. Which is good.

fsck-cache: only show tags if asked to do so with "--tags"

Normally we don't care, we just check them for being valid tag
objects.

Add the git-*-script files to the install

Add example "git-tag-script" to show how to create signed tag objects.

Make "fsck" also show what the name of the tag object is, not just
the name of the object it tags.

You need this if you actually want to build up a list of tags.

Add "tag" objects that can be used to sign other objects.

You use "git-mktag" to create them, and fsck-cache knows how to parse them.

Fix up the types in write_sha1_file

Use "unsigned long" for the size, like we do everywhere else.

Simplify "write_sha1_file()" interfaces

The write function now adds the header to the file by itself, so there
is no reason to duplicate it among all the users any more.

fsck-cache: warn about missing commit dates

Now that we have hopefully converted all old archives, we
can consider it an error.

Update "convert-cache" to handle git itself.

The git archives have some old-date-format commits with timezones
that the converter didn't recognize. Also, make it be quiet about
already-converted dates.

[PATCH] update-cache: add "--ignore-missing" option

This adds an --ignore-missing option to update-cache, which makes it
ignore missing files.  Together with the "-n" option to checkout-cache,
it allows me to do

    checkout-cache -n -f -a && update-cache --ignore-missing --refresh

which only updates and refreshes the files I already have checked out.

Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] checkout-cache: add "-n" option

This adds the "-n" option to checkout-cache which tells it to not check
out new files, only refresh files already checked out.

Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Don't add references to objects we couldn't find.

That would SIGSEGV.

Verify that the object type matches for tree/commit objects even before parsing.

The type doesn't come from the parsing, the type also has to match the usage.

Set object type at object creation time, not object parse time.

Otherwise we can have objects without a type, which is not good.

fsck-cache: notice missing "blob" objects.

We should _not_ mark a blob object "parsed" just because we
looked it up: it gets marked that way only once we've actually
seen it. Otherwise we can never notice a missing blob.

[PATCH] fix segfault in fsck-cache

Here is how to trigger it:

   echo blob 100 > .git/objects/00/ae4e8d3208e09f2cf7a38202a126f728cadb49

Then run fsck-cache. It will try to unpack after the header to calculate
the hash, inflate returns total_out == 0 and memcpy() dies.

The patch below seems to work with ZLIB 1.1 and 1.2.

Signed-off-by: Andreas Gal <gal@uci.edu>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Support a fine-grained diff-tree

This is based on a patch by David Woodhouse, but with the selection
tests much simplified and streamlined.

It makes diff-tree take extra arguments, specifying the files or
directories which should be considered "interesting". Changes in
uninteresting directories are not reported.

Signed-off-by: David Woodhouse <dwmw2@infradead.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] make file merging respect permissions

1) permissions aren't respected in the merge script (primarily because
they're never passed in to it in the first place).  Fix that and also
check for permission conflicts in the merge

2) the delete of a file in both branches may indeed be just that, but it
could also be the indicator of a rename conflict (file moved to
different locations in both branches), so error out and ask the
committer for guidance.

Signed-off-by: James Bottomley <James.Bottomley@SteelEye.com>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Allow multiple date-ordered lists

Make pop_most_recent_commit() return the same objects multiple times, but only
if called with different bits to mark.

This is necessary to make merge-base work again.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Don't add parents to the commit list if we have already
seen them.

Otherwise any merges will make the parent list explode.

Add "rev-list" program that uses the new time-based commit listing.

This is probably what you'd want to see for "git log".

[PATCH] Various transport programs

This patch adds three similar and related programs. http-pull downloads
objects from an HTTP server; rpull downloads objects by using ssh and
rpush on the other side; and rpush uploads objects by using ssh and rpull
on the other side.

The algorithm should be sufficient to make the network throughput required
depend only on how much content is new, not at all on how much content the
repository contains.

The combination should enable people to have remote repositories by way of
ssh login for authenticated users and HTTP for anonymous access.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Replace merge-base implementation

The old implementation was a nice algorithm, but, unfortunately, it could
be confused in some cases and would not necessarily do the obvious thing
if one argument was decended from the other. This version fixes that by
changing the criterion to the most recent common ancestor.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Additional functions for the objects database

This adds two functions: one to check if an object is present in the local
database, and one to add an object to the local database by reading it
from a file descriptor and checking its hash.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Parse tree objects completely

This adds the contents of trees to struct tree.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Add some functions for commit lists

This adds a function for inserting an item in a commit list, a function
for sorting a commit list by date, and a function for progressively
scanning a commit history from most recent to least recent.

Signed-Off-By: Daniel Barkalow <barkalow@iabervon.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Simplify building of programs

Do not first build .o files when building programs.

Signed-off-by: Jonas Fonseca <fonseca@diku.dk>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Fix broken diff-cache output on added files

Added files were errorneously reported with the - prefix by diff-cache,
obviously leading to great confusion.

Signed-off-by: Petr Baudis <pasky@ucw.cz>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Make a hack to convert-cache for missing author dates in old
archives (notably the old sparse one).

Very hacky. But hopefully we can do the conversion once, and never
worry about this ever again.

Make "convert-cache" able to handle the really old archive formats

This includes the old-style "flat tree" object, and the old broken
date format. Well, enough of the date format to convert the sparse
archive, at least.

Use O_NOATIME when opening the sha1 files.

We really don't care about atime, and it sucks to dirty the
inode cache just for it.

This is more than a one-liner only because we need to be able to
clear the O_NOATIME flag in case some of the objects are owned
by others (in which case open will return EPERM), and because not
everybody has the O_NOATIME flag.

[PATCH] PPC assembly implementation of SHA1

Here is a SHA1 implementation with the core written in PPC assembly.
On my 2GHz G5, it does 218MB/s, compared to 135MB/s for the openssl
version or 45MB/s for the mozilla version.

Signed-off-by: Paul Mackerras <paulus@samba.org>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

New "diff-cache" implementation.

This one is about a million times simpler, and much more likely to be
correct too.

Instead of trying to match up a tree object against the index, we just
read in the tree object side-by-side into the index, and just walk the
resulting index file. This was what all the read-tree cleanups were
all getting to.

Move "read_tree()" to "tree.c" to be used as a generic helper function.

Next step: make "diff-cache" use it.

Clean up and simplify read-tree a bit.

This is preparation for moving parts of it into "tree.c" to be used
as a library function.

Add support for alternate SHA1 library implementations.

This one includes the Mozilla SHA1 implementation sent in by Edgar Toernig.
It's dual-licenced under MPL-1.1 or GPL, so in the context of git, we
obviously use the GPL version.

Side note: the Mozilla SHA1 implementation is about twice as fast as the
default openssl one on my G5, but the default openssl one has optimized
x86 assembly language on x86. So choose wisely.

Split up Makefile library list handling with separate entries for
zlib and libssl.

I'll start giving people choices here..

Include <limits.h> in commit.c for ULONG_MAX. Remove old "revision.h".

The old revision.h helper header isn't used any more, but I never noticed
it until I started grepping for ULONG_MAX users.

Add support for a "GIT_INDEX_FILE" environment variable.

We use that to specify alternative index files, which can be useful
if you want to (for example) generate a temporary index file to do
some specific operation that you don't want to mess with your main
one with.

It defaults to the regular ".git/index" if it hasn't been specified.

Add the ability to prefix something to the pathname to "checkout-cache.c"

This basically makes it trivial to use checkout-cache as a "export as
tree" function. Just read the desired tree into the index, and do a

checkout-cache --prefix=export-dir/ -a

and checkout-cache will "export" the cache into the specified directory.

NOTE! The final "/" is important. The exported name is literally just
prefixed with the specified string, so you can also do something like

checkout-cache --prefix=.merged- Makefile

to check out the currently cached copy of "Makefile" into the file
".merged-Makefile".

Fix NSEC compile problem, and properly parse the rev-tree cmd line.

The rev-tree thing just happened to work. It shouldn't have.

[PATCH] Usage-string fixes.

Usage string fixes to make maintenance easier (only one instance
of a string to update not multiple copies).  I've spotted and
corrected inconsistent usage text in diff-tree while doing this.

Also diff-cache and read-tree usage text have been corrected to
match their up-to-date features.  Earlier, neither "--cached"
form of diff-cache nor "-m single-merge" form of read-tree were
described.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Duh, just make git-export.c use the proper syntax, everything is fine.

Fix up some problems from the commit->tree helper patch

Fix up git-export to use the lower-level interfaces for diff generation.

The high-level helpers seem to have forgotten what to do with sha1
names.

[PATCH] Teach read-tree about commit objects

Updates read-tree to use read_tree_with_tree_or_commit_sha1()
function.  The command can take either tree or commit IDs with
this patch.

The change involves a slight modification of how it recurses down
the tree.  Earlier the caller only supplied SHA1 and the recurser
read the object using it, but now it is the caller's responsibility
to read the object and give it to the recurser.  This matches the
way recursive behaviour is done in other tree- related commands.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Teach ls-tree about commit objects

Updates ls-tree.c to use read_tree_with_tree_or_commit_sha1()
function.  The command can take either tree or commit IDs with
this patch.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Teach diff-tree about commit objects

Updates diff-tree.c to use read_tree_with_tree_or_commit_sha1()
function.  The command can take either tree or commit IDs with this patch.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Teach diff-cache about commit objects

Updates diff-cache.c to use read_tree_with_tree_or_commit_sha1()
function.  The end-user visible result is the same --- the command
takes either tree or commit ID.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Accept commit in some places when tree is needed.

This patch implements read_tree_with_tree_or_commit_sha1(),
which can be used when you are interested in reading an unpacked
raw tree data but you do not know nor care if the SHA1 you
obtained your user is a tree ID or a commit ID.  Before this
function's introduction, you would have called read_sha1_file(),
examined its type, parsed it to call read_sha1_file() again if
it is a commit, and verified that the resulting object is a
tree.  Instead, this function does that for you.  It returns
NULL if the given SHA1 is not either a tree or a commit.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] simplify Makefile

Use a generic rule for executables that depend only on the corresponding
.o and on $(LIB_FILE).

Signed-Off-By: Andre Noll <maan@systemlinux.org>
Signed-Off-By: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Improve build: add <unistd.h> and use -O2 instead of -O3

(Nobody should use -O3. It just makes bad inlining decisions).

Make the sha1 of the index file go at the very end of the file.

This allows us to both calculate it and verify it faster.

Speed up index file writing by chunking it nicely.

No point in making 17,000 small writes when you can make just
a couple of hundred nice 8kB writes instead and save a lot
of time.

Make "write_sha1_file()" exit early if the file already exists.

Avoid the compression.

[PATCH] make dotest more amenable to commit message editing

This makes "dotest" a lot nicer to sue, especially for people who were
used to editing the commit comments after-the-fact in BK, which git
doesn't apply.

he syntax is

dotest [-q] mailbox [signoff]

so the command line operates exactly as you're used to.  If you supply
the -q it will query before applying (I also added the [a]pply all the
rest option).  If the signoff file is absent, no signoff line gets
added.

There's also one addition in this:  a checkout-cache line.  I added that
for poor saps like me whose laptop takes minutes to checkout a full
build tree, so I can run dotest in a directory with no checked out
files.

The recent hash/compression switch-over missed the blob creation.

Happily, convert-cache just magically fixes all errors.

Do SHA1 hash _before_ compression.

And add a "convert-cache" program to convert from old-style
to new-style.

[PATCH] init-db.c: create and use safe_create_dir helper

Factor mkdir calls into common safe_create_dir subroutine.

Signed-Off-By: Zach Welch <zw@superlucidity.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] init-db.c: normalize env var handling.

Normalize init-db environment variable handling, allowing the creation
of object directories with something other than DEFAULT_DB_ENVIRONMENT.

Signed-Off-By: Zach Welch <zw@superlucidity.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] init-db.c: cleanup comments

Consolidate comments at top of main.

Signed-Off-By: Zach Welch <zw@superlucidity.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Make "diff-tree" take commit objects too, like "diff-cache" does.

Sometimes it's just easier to not have to look up the "commit"->"tree"
translation by hand first. It's trivial to do inside diff-tree, and
it's just being polite.

Add "diff-cache" helper program to compare a tree (or commit) with
the current cache state and/or working directory.

Very useful to see what has changed since the last commit, either in
the index file or in the whole working directory.

Also very possibly very buggy. Matching the two up is not entirely
trivial.

Make us be better at guessing a good hostname for the email.

It's still just a guess, and the result is not a real email
address anyway. If you want to, you can use COMMIT_AUTHOR_EMAIL
to correct for any git guesses.

Remove duplicate getenv(DB_ENVIRONMENT) call

Noted by Tony Luck.

Add stupid "git export" thing, which can export a git archive
as a set of patches and commentary.

You'd want something like this if you are tracking a git archive
in another SCM format. Notably, we want something like that for
BK users.

Fix init-db shared database case

Noted by Aaron Straus

Update "git-pull-script" to use "read-tree -m" for
reading a single tree too. That should speed up a
trivial merge noticeably.

Also, don't bother reading back the tree we just wrote
when we committed a real merge. It had better be the
same one we still have..

Make "read-tree" know how to do a "1-way merge".

This one just reads one tree, but picks up any matching stat information
from the old index.

Make "read-tree" take the 'stat' information for a merge result from the
old index state if the result matches.

This leaves the stat information in the result tree for any trivial
merges, which is just the way we like it.

Make git-pull-script do the right thing for symlinked HEAD's.

Also exit gracefully if the HEAD pull failed, rather than use
a possibly stale MERGE_HEAD.

Don't parse commit objects more than once.

Yes, the "parse_commit()" already checks for this condition, but
we need to check for it in rev-tree too, so that we don't start
walking the parent chain unnecessarily.

[PATCH] SCSI trees, merges and git status

Doing the latest SCSI merge exposed two bugs in your merge script:

1) It doesn't like a completely new directory (the misc tree contains a
   new drivers/scsi/lpfc)
2) the merge testing logic is wrong.  You only want to exit 1 if the
   merge fails.

Add quotes around the subject line that we print out as being applied.

My brain just flipped when it tried to read the "Applying" as part
of the explanation of the patch, and the sentence didn't make any
sense. The quotes make it clear what's going on.

[PATCH] provide better committer information to commit-tree.c

Here's a small patch to commit-tree.c that does two things:
- allows the committer email address and name to be overridden
  by environment variables (if you don't like the environment
  variable names I've used (COMMIT_AUTHOR_NAME,
  COMMIT_AUTHOR_EMAIL), feel free to change them.)
- provide the proper domainname to the author/committer email
  address (otherwise, my address was only showing up as from the
  hostname.)

This allows people to set sane values for the commit names and email
addresses, preventing odd, private hostnames and domains from being
exposed to the world.

Signed-off-by: Greg Kroah-Hartman <gregkh@suse.de>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Make fsck-cache print the object type for unreachable objects.

This got lost when I updated to Daniel's new object model.

[PATCH] show-diff: Remove stale comments

Patch 1/6 in the series has already cleaned the interface to
call sq_expand(), but the comment before that function still
carries the stale interface warning.  Remove it.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] Do not let rsync obliterate .git/object symbolic link.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Add "dotest" and "applypatch" scripts to actually make things useful.

Also updates "mailinfo" to write the file list.

[PATCH] show-diff.c: -R option for reverse diff.

This adds -R option to obtain reverse diff.

It may be useful in the merge workflow.  After the base of the working
directory is merged and commited, in the working directory:

    $ read-tree <tree-id-of-merged-tree>
    $ show-diff -R

to re-validate if upstream changes make sense, and/or revert or
conflict with local changes you have in the working files.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] show-diff.c: make diff options customizable.

This makes the diff output formatting options customizable via the
environment variables.  The default is still the Linux kernel style.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] show-diff.c: adjust default format for the Linux kernel.

This patch adjusts the default output format of show-diff to match
the Linux kernel style, recommended in Documentation/SubmittingPatches.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] show-diff.c: simplify show_diff_empty.

This patch removes the custom diff generation code from the
show_diff_empty() function.  Instead, just use show_differences().

This reduces the code size; but more importantly, it is needed for
the later patch to give diff options.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] show-diff.c: check unreadbale blob.

This patch fixes show-diff to detect unreadable blob and warn
instead of going ahead and crashing.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

[PATCH] show-diff.c: clean up private buffer use.

This patch fixes sq_expand() and show_differences() not to use and
hold onto its privately allocated buffer, which was a misguided
attempt to reduce calls to malloc but made later changes harder.

Signed-off-by: Junio C Hamano <junkio@cox.net>
Signed-off-by: Linus Torvalds <torvalds@osdl.org>

Add "update-cache --refresh" to git-pull-script to make sure
out index is all ready to go after a pull.

Noted by Russell King

Change merge-cache and git-merge-one-file to use the SHA1 of the file
instead of a checked-out temporary copy.

If merging requires a checked-out-copy, we now do so with "unpack-file".

Add "unpack-file" helper that unpacks a sha1 blob into a tmpfile.