df: remove legacy code skipping "rootfs" monitoring

3512bb1 added code to skip duplicate reporting of `rootfs` mounted on `/`.
f9c1c5b and f0398d0 added generic code to skip any volume mounted twice.

Depending on the order of the entries in `/etc/mtab`, reporting for `/` was
entirely skipped.

This patch basically reverts the first, non-generic patch, as it's
superseded by the 2 others.

Fixes #1402

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

docs: Add info about mode7 requirement for ntpd

Since ntpd-4.2.7p230 "mode 7" requests are ignored by default, and
that's what ntpd plugin uses currently. The ntp daemon must be
explicitly configured to enable mode7 requests.
This patch adds short information about that to collectd.conf manpage.

Related to collectd/collectd#932

Signed-off-by: Jakub Jankowski <shasta@toxcorp.com>

docs: mention regexps for the interface plugin

It is very useful to collect data (or ignore) from a group of interfaces
that are similarly named - especially if the list is dynamic and it's
not feasible to update configuration each time an interface shows up or
disappears. It's possible to use regexps to specify interfaces to
collect data from (or ignore), but it's not clearly stated anywhere in
the documentation.
This is an attempt to improve documentation in this area.

Signed-off-by: Jakub Jankowski <shasta@toxcorp.com>

exec plugin: Revert file mode to 0644.

This fixes a regression from 94e562250296b1435e3e48cd302055d89c4c702b.

virt plugin: make indentation explicit

Fixes this warning raised by gcc-6's new "misleading-indentation"
option:

```
virt.c: In function 'lv_init':
virt.c:331:2: error: statement is indented as if it were guarded by... [-Werror=misleading-indentation]
  return 0;
  ^~~~~~

virt.c:328:5: note: ...this 'if' clause, but it is not
     if (virInitialize () != 0)
     ^~
```

df: remove legacy references to ReportReserved

The ReportReserved option was removed in fcb3cbf. This patch cleans up a
couple of references which got left behind.

write_redis: don't return with lock held

src/utils_latency.c: Fix format string error.

src/utils_latency.c: Ensure that LLONG_MAX is defined.

EPEL5 doesn't have it in <limits.h> apparently.

src/utils_latency.c: Store "bin_width" as cdtime_t.

This solves the integer overflow when passing huge latency values to
latency_counter_add(). In addition to fixing the overflow the function
will now ignore values that are larger than LLONG_MAX, i.e. the longest
possible latency is 272 years. As a nice side-effect, the precission of
latency_counter_get_percentile() is improved.

Issue: #1131

src/utils_latency.c: Fix change_bin_width().

A missing cast when calculating "width_change_ratio" caused all metrics to
be moved to bucket #0.

varnish: fix leak on read

Since VSM_Close doesn't free the object we leak a few bytes
every interval

openvpn plugin: Fix "Dead assignment" warning.

modbus plugin: Make sure variable is initialized.

This was introduced by the merge
(09c6a320f3cb36b5dbb2c2ce43858f33be7acf9b).

tail plugin: Make sure variable is initialized.

This was introduced by the merge
(09c6a320f3cb36b5dbb2c2ce43858f33be7acf9b).

Fix header condition

The dependency is either UTMPX or UTMP or Statgrab. The inclusion above hasn't statgrab.h in the elif-chain, that means compilation fails when only libstatgrab is available. The line can safely be taken out as the same condition is checked in #L120.

Fixed rrdtool sigsegv (datadir==NULL ptr dereferencing)

processes: correct a typo

perl: unlock mutex on error

CID 37970

openvpn: free resource on error

openvpn: fix error message

openvpn: check return value of malloc

CID 37987

curl_json: remove dead code

CID 37963

snmp plugin: don't read from uninitialized pointer

if the first snmp_pdu_create inside the loop returns an error,
we exit the loop with res uninitialized and then call snmp_free_pdu on it.

CID #38037

libcollectdclient: don't close socket twice

CID #38039

email plugin: fix check for result of malloc

CID #38010

collectd.conf.pod: mention IPv6 option to the iptables plugin

Thanks to @michaelsalmon for pointing this out !

Fix #1496

remove the addressof in the sizeof

quick fix for issue 1501?
the new warning for pointer access introduced in gcc 4.8 helped to find
this one.

perl plugin: Check "return value" of PERL_GET_CONTEXT.

CID: 37985

email plugin: Don't call type_list_incr() with type == NULL.

CID: 37988

gmond plugin: Inline the plugin_dispatch_values() call.

Since version 5.3, a write queue is used. This means that the
plugin_dispatch_values() call will create a copy of the value list and
return quickly. Creating yet another copy here is therefore not as useful
anymore.

CID: 38114

gmond plugin: Check return value of sendto(2).

CID: 38113

gmond plugin: Check return value of setsockopt(2).

CID: 38112

configure.ac: warn when pkg-config is not installed

It hasn't been optional for a while now.

Fixes:
checking for rrd.h... no
./configure: 25157: Syntax error: word unexpected (expecting ")")

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

src/utils_ignorelist.c: Refactoring / code style fixes.

One of the goals was to remove uses of smalloc().

swap plugin: don't exit when malloc fails

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

curl_json plugin: Rewrite logic to add a path to db->tree.

CID: 37991

curl_xml plugin: Correctly free xpath object.

CID: 37993
Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

ping plugin: Protect access to ping_thread_error.

This is primarily to make Coverity happy.

CID: 37976

ping plugin: Remove "static" from local variable.

This caused Coverity to see concurrency issues where there are none.

CID: 37934

rrdtool plugin: Improve handling of the "DataDir" option.

CID: 37977

python plugin: Check return value of cpy_unicode_or_bytes_to_string().

CID: 37984

python plugin: Check return value of malloc().

CID: 37981, 37982, 37983

python plugin: Fix memory leak.

The regiser_read / register_write functions assume a user_data_t*
pointing to static memory and will not store / free the pointer.

CID: 38002

tail plugin: Fix memory leak.

CID: 38013

postgresql plugin: Register a new user data pointer with udb_query_set_user_data() unconditionally.

CID: 38019

email plugin: Refactor the accept() loop.

This removes the assumption that accept() returning a socket (success)
implies that errno is not equal to EINTR. This is probably a reasonable
assumption, but trips up Coverity may be a bit hard to read.

CID: 38009

email plugin: Free "connection" in error handling.

CID: 38010

postgresql plugin: Remove invalid free().

CID: 37936

src/collectd-tg.c: Explicitly null-terminate string.

CID: 37937
Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

src/utils_format_json.c: Make sure "keys" is freed in all error paths.

CID: 38008

sigrok plugin: don't pass status to strerror

CID #38120

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

multimeter plugin: Initizliaze "struct termios".

CID: 38036

configure.ac: fix previous change to detect libjvm

This worked on OSX but failed on Linux.

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

meta_data.c: check return value of md_entry_alloc

CID #37986

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

iptables plugin: remove dead code

ip version is either IPv4 or IPv6

CID #37962

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

src/filter_chain.c: Refactor fc_process_chain() a wee bit.

src/filter_chain.c: Delete dead code.

CID: 37961

src/common.c: Check arguments of parse_values().

CID: 37965

libcollectdclient: Check return value of setsockopt().

Coverity CID 37944.

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

configure.ac: fix libjvm detection on OSX

Shared libraries have the extension .dylib instead of .so

Ideally we look at shrext_cmds from libtool to find the shared library
extension but this works too.

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

unixsock: check return value of chmod

CID #37948

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

bind plugin: plug small leak

CID #37992

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

curl_xml plugin: plug a few leaks on error

CID #37993

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

stats plugin: close fd on error

CID #37995

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

utils_cache.c: plug leak on error

CID #38000

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

Aggregration plugin: plug leak on error

CID #38005

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

varnish plugin: fix two resource leaks on error

CID #42774

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

libcollectdclient: free result of getaddrinfo

CID #37997

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

madwifi: make code a little bit clearer

buf2 is initialized to zero, readlink
will write at most sizeof(buf2) -1 bytes,
so the trailing null should not be overwritten.

Coverity doesn't see that, rewrite the code
differently so it does.

CID #38027

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

Pinba plugin: close fd on error

CID #38001

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

configfile.c: close dir on error

CID #38006

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

utils_fbhash.c: fix resource leak on error

CID #38014

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

multimeter plugin: fix fd leak

If open returns 0 we leak fd.

CID #38016

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

postgresql plugin: don't exit on malloc failure

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

perl: Check for NULL before dereferencing

CID #38023

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

table plugin: fix check for realloc

We were checking the wrong thing.

CID #38024

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

utils_mount.c: check for null before dereferencing

CID #38025

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

teamspeak2: fix potential use after close

If connecting to the last host fails, we exit the loop
with a closed fd, which we try to fdopen() later on.

CID #38038

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

threshold plugin: Register callbacks only once.

Fixes: #551
Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

df plugin: Fix the duplicate detection.

Not that multiple devices could be mounted at the same mount point ... I think.

Fixes: #1402

df plugin: skip duplicate entries, fixes "uc_update: Value too old" error

Issue: #1402

vmem plugin: Fix pgsteal for newer Linux kernels.

Fixes: #1307

Link collectd-tg with pthreads

Signed-off-by: Florian Forster <octo@collectd.org>

irq plugin: close file descriptor on failure

CID 38018

modbus plugin: fix 2 leaks on error paths

filecount plugin: fix leak on error path

bind: tmp doesn't point to start of allocated memory

amqp: use the right buffer size for sstrncpy

buffer is a char *, not an array, so size_of returns the size
of the pointer.

powerdns plugin: fix array initialization

Fix build with older version of libprotobuf-c

gcrypt: take search path into account

gcrypt: remove exec-prefix check

libgcrypt-config --libs already includes the correct library include path.
Also, we hardcoded it to $exec-prefix/lib, which is just plain wrong on
64bit architectures.

protoc: check for headers in new location as well

Newer versions of protobuf-c have their headers in
/usr/include/protobuf-c, and a symlink from
/usr/include/google/protobuf-c/.

These symlinks will eventually disappear however, so be prepared.

protoc: check for libprotobuf-c as well

protoc: simplify configure check

protoc: slightly nicer output in silent mode

make[1]: Entering directory '/home/ruben/src/collectd/src'
  PROTOC-C     pinba.pb-c.c
  PROTOC-C     riemann.pb-c.c

protoc: log when compiler is missing

In the case where we do have the required headers
but don't have the compiler, this makes it more clear
that we're missing the latter.

Silence protoc-c in silence mode

Instead of showing the full command line, this shows:
  GEN      pinba.pb-c.c
  GEN      riemann.pb-c.c

write_riemann: only compile .proto files when enabled

If the write_riemann plugin is not enabled there's no
need to compile the protobuf files.