uptime plugin: don't cache boot time and simplify Linux code

Caching boottime on startup yields incorrect uptime values if system
date changes after the daemon is started.
This is almost certain to happen on embedded systems without RTC, where
clock is set from NTP server at some point after boot process.

On Linux, we can retrieve uptime directly by either reading /proc/uptime
(it's sufficient to read a few bytes) or calling sysinfo() function.
Use the latter since it's the most efficient way in speed, memory
requirements and code simplicity terms.

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2442'

zfs_arc plugin: Avoid resetting global variables from init().

Fixes: #973

zfs_arc: derive hit/miss stats for ratio calculations

tail plugin: Allow to set "bucket" metrics type

When several distributions needs to be calculated in one 'tail' instance,
all their metrics will be reported as single 'bucket' type with the same plugin instance value.
That is confusing and this patch allows to split these metrics to their own types.

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2439'

cpu plugin: add new options to the default configuration file.

cpu plugin: adjust numfields conditions in cpu_read().

cpu plugin: adjust coding style (variable declaration).

cpu plugin: update documentation.

cpu plugin: subtract guest states from user/nice.

Merge pull request #2441 from zerkms/ISSUE-2433

Added `ReportIO` option to the `swap` plugin

swap plugin: Added `ReportIO` option

lxc/lxd containers at the moment cannot properly report the swap io (the corresponding /proc/vmstat are not virtualized), so added an option to disable that reporting.
Enabled by default.

Closes: #2433

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2377'

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2434'

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2435'

Merge branch 'collectd-5.7'

Merge branch 'collectd-5.6' into collectd-5.7

src/daemon/collectd.c: Fix implementation of the -B option.

Also add a manual page entry.

Issue: #2421
Pull-Request: #2422

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2422'

Fixes: #2421

table: Allow custom plugin name to be reported

Add daemon option to avoid making BaseDir

One possible implementation of collectd/collectd#2421

openvpn: Changes after review, clang-formatting

openvpn: reworked status file parser

 * Added detection of status fields index by parsing 'HEADER' lines.
   This allows to support status files from latest OpenVPN-2.4 and possible from future versions;
 * Fixed a bug with OpenVPN status file version 3 where delimiter is 'tab' (not space or comma);
 * Status file version detection was moved from configuration callback to read callback;
 * Now 'plugin_register_complex_read()' is used for registering read callback.

Closes: #2128

cpu plugin: add linux-specific "guest" states.

collectd.conf(5): Document dependencies between mqtt's TLS options better.

mqtt plugin: Add support for TLS in Subscriber blocks.

Fixes: #2419

perl plugin: Improve error message.

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2391' into collectd-5.6

nfs plugin: Fix typo

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2430'

Merge branch 'pr/2431'

uptime plugin: Coding style update.

This is only touching the Linux code, though.

nfs plugin: Changes after review

* Avoid negated config options (s/IgnoreV/ReportV/)
* Use _Bool instead of int
* Handle multiple occurences of config option correctly

Merge branch 'collectd-5.7'

Reimplemented `uptime` plugin to read from `/proc/uptime`

synproxy plugin: Re-run clang-format.

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2381'

Merge pull request #2417 from bluca/dpdk_pkgconfig_backport

configure.ac: dpdk: use pkg-config - 5.7

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2412'

use generic types in synproxy plugin and code refactoring

Fix source path in automake

New plugin: synproxy

nfs: Add config options to ignore versions

README: NFSv4 is supported nowadays

(implemented with commit 64446a66fe)

collectd.spec: avoid accidentally picking an ancient/unsupported java version

ntpd: Correct loop offset and error calculation

Stop the scaling calculation dropping the sign of the underlying value

Fixes: #2188

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2258'

Treewide: Don't set value_list_t.host to hostname_g.

plugin_dispatch_values() will automatically fill that value in.

libcollectdclient: Guard gcrypt code with preprocessor conditionals.

libcollectdclient: Include <stdlib.h> and <string.h>.

For free(3) and memmove(3) respectively.

collectd.spec: add new intel_pmu plugin

configure.ac: fix indentation

Merge pull request #2405 from cpaelzer/fix-dpdk-pkg-config-if-not-available

configure.ac: dpdk: tolerate no pkg-config

configure.ac: follow the 2 space indent style

The rest of configure.ac indents not to the context, but by 2 spaces.
Follow that rule to stay in style.

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

configure.ac: fix indent

Fix tab indents to be space based as they should, but keep the
effective indent at the level of the context it belongs to in
PKG_CHECK_MODULES.

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

configure.ac: dpdk: use pkg-config

To detect cflags and libs use the sometimes provided pkg-config for
libdpdk. That avoids build errors on systems where special flags are
needed and provided by dpdk via pkg-config, but not yet considered by
the collectd build system.

configure.ac: dpdk: tolerate no pkg-config

Since pull request #2400 pkg-config works great for dpdk, but not if
there is no pkg-config around at all.
To fix that the PKG_CHECK_MODULES macro needs to define a valid fourth
argument, otherwise it will error out.

This closes 2404

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

Merge pull request #2400 from cpaelzer/fix-dpdk-multiarch-pkg-config

configure.ac: dpdk: use pkg-config

configure.ac: dpdk: append DPDK_CFLAGS to LIBDPDK_CPPFLAGS

In some way it is bad naming in pkg-config - it is always some sort of
conflated ldflags + libs and cppflags + cxxflags + cflags.
Due to that to work correctly we append DPDK_CFLAGS (if defined by
pkg-config) to LIBDPDK_CPPFLAGS as well.
This intentionally does not add those CFLAGS specified by a user to
allow full override and fully separated CLFAGS/CPPFLAGS if needed.

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

configure.ac: dpdk: introduce LIBDPDK_CFLAGS

This restores the former behavior of LIBDPDK_CPPFLAGS and now
correctly carries CFLAGS read from pkg-config in its own variable.

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

configure.ac: dpdk: use pkg-config

To detect cflags and libs use the sometimes provided pkg-config for
libdpdk. That avoids build errors on systems where special flags are
needed and provided by dpdk via pkg-config, but not yet considered by
the collectd build system.

This closes #2399

Signed-off-by: Christian Ehrhardt <christian.ehrhardt@canonical.com>

perl plugin: Added check of proper interpreter initialization.

Closes: #927

Merge pull request #2378 from cramertj/grpc-meta

Add metadata support to GRPC plugin

Merge pull request #2380 from maryamtahhan/feat_mcelog_bugfixes

mcelog: fix compilation error caused by migration to snprintf().

GRPC metadata review cleanup

openldap: Fix plugin shutdown with connection failed

When plugin failes to connect to LDAP server, the `ldap_unbind_ext_s(st->ld)` is called.
According to `man 3 ldap_unbind_ext_s`, that call is used to free the resources contained in the ld structure.
When plugin shutdown, the `ldap_unbind_ext_s` called again, which causes coredump.

The plugin code was changed to set st->ld to NULL after `ldap_unbind_ext_s()` call.

mcelog: fix compilation error caused by migration to snprintf().

Change-Id: I625254fa60efbb94580ed2eb69d7c7bf7027a6eb
Signed-off-by: Korynkevych, RomanX <romanx.korynkevych@intel.com>

Add metadata support to GRPC plugin

Merge pull request #2246 from maryamtahhan/feat_mcelog_notification_bugfixes

Feat mcelog notification bugfixes

mcelog: updates based on review comments

* modified code to use return without parenthesis
* fixed logic that parses config options

Change-Id: I2c5c5f42f8395306622dee8cdf4f94b46e3e3570
Signed-off-by: Korynkevych, RomanX <romanx.korynkevych@intel.com>

Merge pull request #2349 from rpv-tomsk/fix-register-complex-read

Free `userdata` if plugin_register_complex_read() has failed.

openldap: Fixed possible dereference of NULL pointer

If `plugin_register_complex_read()` has failed, then `cldap_free` is called which set pointer to NULL.
That pointer is accessed by `cldap_shutdown()` callback later.

Change error message when read callback name is duplicated while registering it.

The message `Check for duplicate "LoadPlugin" lines` is obsolete, as there is a special check in `plugin_load()` for this case.

Free `userdata` if plugin_register_complex_read() has failed.

Merge pull request #2375 from rpv-tomsk/small-fix

network: Fix free() before use

network: Fix free() before use

Merge pull request #2374 from maryamtahhan/feat_intel_pmu_bugfixes

intel_pmu: fix compilation error caused by migration to snprintf().

intel_pmu: fix compilation error caused by migration to snprintf().

Change-Id: I4e461cd11aa03ca588649ca86892c23c9f38fc54
Signed-off-by: Korynkevych, RomanX <romanx.korynkevych@intel.com>

Merge branch 'collectd-5.7'

Conflicts:
src/rrdtool.c

Merge branch 'collectd-5.6' into collectd-5.7

Conflicts:
src/rrdtool.c

Merge pull request #2232 from rpv-tomsk/processes

processes: Show real disk IO in addition to process IO (Linux only)

rrdtool plugin: Changes after review

* Handle "CacheFlush" as a double
* Updated documentation spelling

rrdtool plugin: Respect RandomTimeout while calling CacheFlush handler

The CacheFlush implementation does not respect RandomTimeout value.
All cache values, whose flush is deferred by RandomTimeout variance,
will be flushed. That can cause a partial or full cache flush,
depending on the value of RandomTimeout.

rrdtool plugin: Configuration check moved to init callback

The "RandomTimeout" option value check moved from rrd_get_random_variation()
to rrd_init(). This will save few CPU cycles.

rrdtool plugin: Remove excessive complain

The plugin complains `Adjusting "RandomTimeout" to 0.000 seconds.` even
if no 'CacheTimeout' was set.

rrdtool plugin: Raise interval of random_variation to match documentation

Documentation states what the actual timeout for each value is chosen randomly
between <CacheTimeout>-<RandomTimeout> and <CacheTimeout>+<RandomTimeout>.

The implementation did not match this.

rrdtool plugin: Fix flushing

* Value from wrong option was passed to rrd_cache_flush()
* Variable cache_flush_timeout was used as cdtime_t type time while value was set as simple seconds
* Added info message about CacheFlush ajusting
* Documentation updated

Merge remote-tracking branch 'github/pr/2276'

Merge pull request #2366 from axibase/ssnprintf-fix

Fix build: left ssnprintf in test

Fix left ssnprintf in test

intel_rdt plugin: fix style

nut plugin: remove trailing whitespace

Merge branch 'ssnprintf-cleanup'

Conflicts:
src/dpdkevents.c
src/utils_dpdk.c
src/write_mongodb.c

Run clang-format after removing ssnprintf

Changing ssnprintf to snprintf changed the indentation.

Merge pull request #2354 from rpv-tomsk/issue-2344-nut-rework

nut plugin: Multi-threaded ups polling with connect timeout.

Merge branch 'master' into feat_mcelog_notification_bugfixes

mcelog: updates based on github review

* Reduces complex level of indentation in conditional blocks
* Uses #defines for corrected and uncorrected strings for notifications
* Fixes memory leaks
* clang was run on the mcelog.c

Change-Id: Ia4c08debc129e2fc9327922299a68304b101d09f
Signed-off-by: Tahhan, Maryam <maryam.tahhan@intel.com>

Merge pull request #2362 from rpv-tomsk/issue-2338

snmp_agent: Fixes and improvements

snmp_agent: Documented 'PluginInstance' option